日米学生会議の活動は、事前活動、本会議、事後活動の3つに分けられている。事前活動では、勉強会を開くなどして、本会議を充実したものにするために入念な準備をする。本会議では、様々なテーマや形態で討論を繰り広げるほか、参加者同士の交流を促す企画がある。また、事後活動では、本会議の成果を社会へ発信する努力を行う。このように、日米学生会議は、長期間に渡る意見交換の場を提供していく。